La Resolución Exenta N° 2342, del 2 de diciembre de 2025, aprobó la nueva estructura organizacional y objetivos de las coordinaciones que conforman el Archivo Nacional:
- Dirección del Archivo Nacional
- Coordinaciones:
- Coordinación del Archivo Nacional Histórico
- Coordinación del Archivo Nacional de la Administración
- Coordinación del Archivo Nacional de la Memoria
- Coordinación Técnico Normativa
- Coordinación de Vinculación con el Medio
- Coordinación de Desarrollo Tecnológico
- Coordinación de Desarrollo Institucional
- Coordinación de Administración y Finanzas.
